食品科学教育部重点实验室是2002年1月11日经中华人民共和国教育部批准成立并正式对外开放的，是我国食品领域第一个教育部重点实验室。实验室立足江西、面向全国，坚持“四个面向”，围绕国家发展战略要求，紧跟食品科技国际研究前沿，发挥多学科交叉和国际合作特色与优势，以“食品科学与人类健康、食物资源高值化利用”为研究主题，开展食品与人体健康相关性、食物资源挖掘与高效利用等研究；系统研究食品科学领域的重大理论与关键技术，从而为解决关系国计民生的食品营养与安全以及食物资源高效利用等重大问题提供理论指导与技术支持。实验室集中了南昌大学相关学科优秀的人才资源，形成了以中国工程院院士、国际食品科学院院士、国务院学位委员会学科评议组成员、教育部科学技术委员会学部委员等国家级人才和知名专家学者为学术带头人，一批年富力强海内外博士等中青年学术骨干为中坚力量的研究团队。实验室按照“开放、流动、联合、竞争”的原则，经过多年建设，实验室人才梯队结构合理，具有良好的科研条件，取得了一批高水平科研成果，在成果转化和服务经济建设中富有成效，整体水平位居我国食品学科领域前列。
      3年来，实验室近发表SCI论文1500余篇，编写著作和教材20部，其中英文著作5部；授权国家发明专利300余件。基地在上述合作成果的基础上，取得了一批高水平科研成果，基地负责人谢明勇教授获何梁何利基金科学与技术创新奖，基地聂少平教授的成果“富含多糖的营养健康食品创制关键技术与产业化”获得2023年国家科学技术进步二等奖；此外，基地获江西省科学技术特别贡献奖、江西省科技进步一等奖、江西省自然科学一等奖、中国食品科技十大进展、江西省十大科技成果等省部级及以上奖励30余项。
      同时，实验室与伊利集团、汇仁药业、蜡笔小新（福建）食品工业有限公司、江中食疗科技有限公司、澳优乳业（中国）有限公司、无限极（中国）有限公司、江西齐云山食品有限公司、江西煌上煌集团食品股份有限公司、江西阳光乳业集团、南昌旷达生物科技有限公司等企业开展产学研合作，实现了一批科研成果的转化与产业化。仅以上述国家奖和相关省部级一等奖技术转让或者成果应用统计，所实现的直接产值超过百亿元。这些科技成果的成功应用，有效推动了食品产业进步，经济和社会效益显著。为服务国家及地方经济建设、支撑和引领我国食品领域的科技创新和产业发展做出了重要贡献。